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IBM挖掘微生物測序價值

發(fā)布時間:2014-12-02      瀏覽次數(shù):2408    分享:

  導(dǎo)讀:3月份,IBM表示他們將利用其超級計算機“沃森”的云計算系統(tǒng)與位于紐約的基因組研究中心合作,幫助開發(fā)治療腦膠質(zhì)瘤的方案,以期戰(zhàn)勝人類腦癌,而近期IBM表示擬通過對生活環(huán)境(農(nóng)場、地鐵等)中的微生物進(jìn)行測序,挖掘自然環(huán)境中大量有益微生物。

  2009年10月份,IBM宣布,將加入到降低個人基因組測序成本的競爭中,不僅有望將價格降低到1000美元以下,最終甚至有可能降至100美元的水平。

  早在2010年1月份,IBM Thomas J. Watson實驗室(Yorktown Heights, NY, USA)的計算生物中心高級經(jīng)理Ajay Royyuru就對外宣傳過"生物學(xué)越來越成為一種信息學(xué)科學(xué),對于IBM而言更是一種業(yè)務(wù)",而后者正是IBM的專長所在,因此IBM計劃設(shè)計發(fā)明出更快更便宜的測序技術(shù)。

  也就是在當(dāng)年的7月份左右,羅氏和IBM公司宣布將共同開發(fā)基于納米孔的測序技術(shù),擬采用IBM研發(fā)部門開發(fā)的DNA Transistor技術(shù)來快速高效地對人類DNA進(jìn)行直接讀取和測序。當(dāng)DNA分子穿過硅芯片上納米大小的孔時,該技術(shù)能破譯DNA分子,從而實現(xiàn)真正的單分子測序。根據(jù)羅氏和IBM當(dāng)時的說法,與其它現(xiàn)有測序技術(shù)或正在開發(fā)的技術(shù)相比,這項技術(shù)在費用、通量、規(guī)模和速度上都具有“重大優(yōu)勢”。

 

\"生物科技\"

 

  然而在2013年,羅氏卻宣布因涉及的技術(shù)風(fēng)險較高,結(jié)束了與IBM合作開發(fā)納米孔測序平臺的伙伴關(guān)系。

  2013年4月9日 IBM和CLC生物信息公司將結(jié)合二者的硬件和軟件產(chǎn)品,聯(lián)合為客戶提供一個高通量測序數(shù)據(jù)分析的一條龍服務(wù)平臺。平臺有3種不同的配置,從48個CPU和192GB內(nèi)存到192個CPU和768GB內(nèi)存,取決于客戶的要求。

  在今年的3月19日,IBM表示他們將利用其超級計算機“沃森”的云計算系統(tǒng)與位于紐約的基因組研究中心合作,幫助開發(fā)治療腦膠質(zhì)瘤的方案,以期戰(zhàn)勝人類腦癌。

  在4月份,各大外媒也紛紛報道IBM公司喜歡大數(shù)據(jù),獲取的越多,就越能向用戶銷售出更多的服務(wù)器、存儲和服務(wù),并將充分利用大數(shù)據(jù)變革醫(yī)療行業(yè)。

  5月6日至7日,在IBM硅谷阿爾馬登研究中心召開了“為城市測序:在大數(shù)據(jù)時代的宏基因組學(xué)”的專題研討會。其中比較受業(yè)內(nèi)人士關(guān)注的是來自全球領(lǐng)先的科技新聞網(wǎng)站CNET News中的一篇報道“IBM sees big opportunity in sequencing microbes”。文章中指出,IBM公司擬通過對生活環(huán)境(農(nóng)場、地鐵等)中的微生物進(jìn)行測序,挖掘自然環(huán)境中大量有益微生物。

  在地球這個生態(tài)系統(tǒng)中,存在著大量的微生物,盡管目前世界上已經(jīng)建立了3000多種細(xì)菌的全基因組數(shù)據(jù)庫,隨著技術(shù)的開放,獲取這些數(shù)據(jù)庫也越來越便宜。

 

(來源:生物探索 由生化廠轉(zhuǎn)載)

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